Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4T4

Ccdc71l, Coiled-coil domain-containing 71-like, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71lE9Q4T4 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms