Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Gm40761-201ENSMUST00000219123 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Ftl1-204ENSMUST00000210864 503 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Gpr137b-ps-202ENSMUST00000220647 1159 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 AC112146.1-201ENSMUST00000221641 733 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 Etv1-205ENSMUST00000160856 1474 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 Polr2j-203ENSMUST00000111129 474 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 CT030135.2-201ENSMUST00000225255 893 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 Gm5909-201ENSMUST00000119768 1281 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms