Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms