Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms