Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms