Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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Phf11bB4XVQ1 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
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