Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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