Protein–RNA interactions for Protein: B2RRF6

Znf518a, Zinc finger protein 518A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf518aB2RRF6 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Znf518aB2RRF6 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Znf518aB2RRF6 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Znf518aB2RRF6 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Znf518aB2RRF6 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf518aB2RRF6 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf518aB2RRF6 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf518aB2RRF6 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf518aB2RRF6 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf518aB2RRF6 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf518aB2RRF6 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf518aB2RRF6 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf518aB2RRF6 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf518aB2RRF6 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf518aB2RRF6 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf518aB2RRF6 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf518aB2RRF6 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf518aB2RRF6 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf518aB2RRF6 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf518aB2RRF6 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf518aB2RRF6 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf518aB2RRF6 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf518aB2RRF6 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf518aB2RRF6 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf518aB2RRF6 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf518aB2RRF6 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf518aB2RRF6 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf518aB2RRF6 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf518aB2RRF6 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf518aB2RRF6 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf518aB2RRF6 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf518aB2RRF6 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf518aB2RRF6 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf518aB2RRF6 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf518aB2RRF6 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf518aB2RRF6 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf518aB2RRF6 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf518aB2RRF6 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf518aB2RRF6 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf518aB2RRF6 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf518aB2RRF6 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf518aB2RRF6 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf518aB2RRF6 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf518aB2RRF6 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf518aB2RRF6 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf518aB2RRF6 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf518aB2RRF6 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf518aB2RRF6 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf518aB2RRF6 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf518aB2RRF6 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf518aB2RRF6 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf518aB2RRF6 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf518aB2RRF6 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf518aB2RRF6 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf518aB2RRF6 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf518aB2RRF6 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf518aB2RRF6 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf518aB2RRF6 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf518aB2RRF6 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf518aB2RRF6 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf518aB2RRF6 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf518aB2RRF6 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf518aB2RRF6 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf518aB2RRF6 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf518aB2RRF6 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf518aB2RRF6 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf518aB2RRF6 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf518aB2RRF6 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf518aB2RRF6 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf518aB2RRF6 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf518aB2RRF6 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf518aB2RRF6 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf518aB2RRF6 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf518aB2RRF6 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf518aB2RRF6 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf518aB2RRF6 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf518aB2RRF6 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf518aB2RRF6 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf518aB2RRF6 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf518aB2RRF6 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf518aB2RRF6 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf518aB2RRF6 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf518aB2RRF6 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf518aB2RRF6 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf518aB2RRF6 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf518aB2RRF6 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf518aB2RRF6 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf518aB2RRF6 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf518aB2RRF6 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf518aB2RRF6 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Znf518aB2RRF6 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Znf518aB2RRF6 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Znf518aB2RRF6 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Znf518aB2RRF6 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Znf518aB2RRF6 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Znf518aB2RRF6 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Znf518aB2RRF6 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Znf518aB2RRF6 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Znf518aB2RRF6 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Znf518aB2RRF6 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms