Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms