Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Brpf3B2KF05 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Brpf3B2KF05 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Brpf3B2KF05 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Brpf3B2KF05 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Brpf3B2KF05 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Brpf3B2KF05 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Brpf3B2KF05 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Brpf3B2KF05 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Brpf3B2KF05 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Brpf3B2KF05 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Brpf3B2KF05 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Brpf3B2KF05 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Brpf3B2KF05 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Brpf3B2KF05 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Brpf3B2KF05 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Brpf3B2KF05 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Brpf3B2KF05 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Brpf3B2KF05 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Brpf3B2KF05 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Brpf3B2KF05 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Brpf3B2KF05 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Brpf3B2KF05 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Brpf3B2KF05 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Brpf3B2KF05 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Brpf3B2KF05 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Brpf3B2KF05 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Brpf3B2KF05 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Brpf3B2KF05 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Brpf3B2KF05 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Brpf3B2KF05 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Brpf3B2KF05 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Brpf3B2KF05 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Brpf3B2KF05 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Brpf3B2KF05 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Brpf3B2KF05 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Brpf3B2KF05 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Brpf3B2KF05 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Brpf3B2KF05 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Brpf3B2KF05 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Brpf3B2KF05 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Brpf3B2KF05 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Brpf3B2KF05 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Brpf3B2KF05 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Brpf3B2KF05 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Brpf3B2KF05 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Brpf3B2KF05 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Brpf3B2KF05 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Brpf3B2KF05 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Brpf3B2KF05 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Brpf3B2KF05 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Brpf3B2KF05 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Brpf3B2KF05 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Brpf3B2KF05 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Brpf3B2KF05 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Brpf3B2KF05 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Brpf3B2KF05 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Brpf3B2KF05 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Brpf3B2KF05 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Brpf3B2KF05 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Brpf3B2KF05 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Brpf3B2KF05 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Brpf3B2KF05 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Brpf3B2KF05 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Brpf3B2KF05 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Brpf3B2KF05 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Brpf3B2KF05 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Brpf3B2KF05 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Brpf3B2KF05 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Brpf3B2KF05 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Brpf3B2KF05 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Brpf3B2KF05 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Brpf3B2KF05 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Brpf3B2KF05 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Brpf3B2KF05 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Brpf3B2KF05 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Brpf3B2KF05 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Brpf3B2KF05 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Brpf3B2KF05 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Brpf3B2KF05 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Brpf3B2KF05 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Brpf3B2KF05 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Brpf3B2KF05 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Brpf3B2KF05 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Brpf3B2KF05 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Brpf3B2KF05 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Brpf3B2KF05 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Brpf3B2KF05 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Brpf3B2KF05 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Brpf3B2KF05 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Brpf3B2KF05 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Brpf3B2KF05 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Brpf3B2KF05 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Brpf3B2KF05 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Brpf3B2KF05 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Brpf3B2KF05 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Brpf3B2KF05 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Brpf3B2KF05 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Brpf3B2KF05 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Brpf3B2KF05 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms