Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

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Length 936 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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