Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
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H2-M5A7VMS3 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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H2-M5A7VMS3 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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