Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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