Protein–RNA interactions for Protein: A2ABU4

Myom3, Myomesin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myom3A2ABU4 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms