Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pramef6A2A8M8 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pramef6A2A8M8 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pramef6A2A8M8 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pramef6A2A8M8 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pramef6A2A8M8 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pramef6A2A8M8 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pramef6A2A8M8 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pramef6A2A8M8 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pramef6A2A8M8 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pramef6A2A8M8 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pramef6A2A8M8 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pramef6A2A8M8 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pramef6A2A8M8 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pramef6A2A8M8 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pramef6A2A8M8 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Pramef6A2A8M8 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pramef6A2A8M8 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Pramef6A2A8M8 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pramef6A2A8M8 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pramef6A2A8M8 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pramef6A2A8M8 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pramef6A2A8M8 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pramef6A2A8M8 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pramef6A2A8M8 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pramef6A2A8M8 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pramef6A2A8M8 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pramef6A2A8M8 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pramef6A2A8M8 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pramef6A2A8M8 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pramef6A2A8M8 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Pramef6A2A8M8 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Pramef6A2A8M8 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pramef6A2A8M8 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pramef6A2A8M8 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Pramef6A2A8M8 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pramef6A2A8M8 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pramef6A2A8M8 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pramef6A2A8M8 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pramef6A2A8M8 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pramef6A2A8M8 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pramef6A2A8M8 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Pramef6A2A8M8 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pramef6A2A8M8 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pramef6A2A8M8 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pramef6A2A8M8 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pramef6A2A8M8 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pramef6A2A8M8 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pramef6A2A8M8 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pramef6A2A8M8 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pramef6A2A8M8 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pramef6A2A8M8 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pramef6A2A8M8 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pramef6A2A8M8 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pramef6A2A8M8 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pramef6A2A8M8 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pramef6A2A8M8 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pramef6A2A8M8 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pramef6A2A8M8 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pramef6A2A8M8 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pramef6A2A8M8 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pramef6A2A8M8 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pramef6A2A8M8 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pramef6A2A8M8 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pramef6A2A8M8 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pramef6A2A8M8 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pramef6A2A8M8 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pramef6A2A8M8 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pramef6A2A8M8 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pramef6A2A8M8 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pramef6A2A8M8 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pramef6A2A8M8 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pramef6A2A8M8 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pramef6A2A8M8 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pramef6A2A8M8 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pramef6A2A8M8 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pramef6A2A8M8 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pramef6A2A8M8 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pramef6A2A8M8 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pramef6A2A8M8 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pramef6A2A8M8 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pramef6A2A8M8 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pramef6A2A8M8 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pramef6A2A8M8 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pramef6A2A8M8 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pramef6A2A8M8 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pramef6A2A8M8 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pramef6A2A8M8 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pramef6A2A8M8 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pramef6A2A8M8 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pramef6A2A8M8 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pramef6A2A8M8 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pramef6A2A8M8 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pramef6A2A8M8 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pramef6A2A8M8 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pramef6A2A8M8 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pramef6A2A8M8 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pramef6A2A8M8 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Pramef6A2A8M8 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Pramef6A2A8M8 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms