Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms