Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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