Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms