Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0H8

Clip2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip2Q9Z0H8 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clip2Q9Z0H8 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clip2Q9Z0H8 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clip2Q9Z0H8 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clip2Q9Z0H8 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clip2Q9Z0H8 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Clip2Q9Z0H8 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clip2Q9Z0H8 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clip2Q9Z0H8 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clip2Q9Z0H8 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clip2Q9Z0H8 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clip2Q9Z0H8 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clip2Q9Z0H8 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clip2Q9Z0H8 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clip2Q9Z0H8 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clip2Q9Z0H8 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clip2Q9Z0H8 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clip2Q9Z0H8 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clip2Q9Z0H8 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clip2Q9Z0H8 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Clip2Q9Z0H8 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Clip2Q9Z0H8 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Clip2Q9Z0H8 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Clip2Q9Z0H8 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Clip2Q9Z0H8 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clip2Q9Z0H8 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clip2Q9Z0H8 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clip2Q9Z0H8 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Clip2Q9Z0H8 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clip2Q9Z0H8 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clip2Q9Z0H8 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clip2Q9Z0H8 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clip2Q9Z0H8 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clip2Q9Z0H8 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clip2Q9Z0H8 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clip2Q9Z0H8 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clip2Q9Z0H8 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clip2Q9Z0H8 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clip2Q9Z0H8 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clip2Q9Z0H8 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clip2Q9Z0H8 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clip2Q9Z0H8 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clip2Q9Z0H8 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clip2Q9Z0H8 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clip2Q9Z0H8 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Clip2Q9Z0H8 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Clip2Q9Z0H8 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Clip2Q9Z0H8 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Clip2Q9Z0H8 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Clip2Q9Z0H8 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Clip2Q9Z0H8 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Clip2Q9Z0H8 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Clip2Q9Z0H8 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clip2Q9Z0H8 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clip2Q9Z0H8 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Clip2Q9Z0H8 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clip2Q9Z0H8 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clip2Q9Z0H8 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clip2Q9Z0H8 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clip2Q9Z0H8 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clip2Q9Z0H8 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Clip2Q9Z0H8 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clip2Q9Z0H8 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Clip2Q9Z0H8 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clip2Q9Z0H8 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Clip2Q9Z0H8 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Clip2Q9Z0H8 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Clip2Q9Z0H8 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clip2Q9Z0H8 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Clip2Q9Z0H8 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clip2Q9Z0H8 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clip2Q9Z0H8 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clip2Q9Z0H8 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clip2Q9Z0H8 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Clip2Q9Z0H8 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Clip2Q9Z0H8 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clip2Q9Z0H8 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clip2Q9Z0H8 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clip2Q9Z0H8 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clip2Q9Z0H8 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clip2Q9Z0H8 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clip2Q9Z0H8 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clip2Q9Z0H8 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clip2Q9Z0H8 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Clip2Q9Z0H8 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Clip2Q9Z0H8 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clip2Q9Z0H8 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clip2Q9Z0H8 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clip2Q9Z0H8 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clip2Q9Z0H8 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clip2Q9Z0H8 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clip2Q9Z0H8 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clip2Q9Z0H8 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Clip2Q9Z0H8 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Clip2Q9Z0H8 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clip2Q9Z0H8 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Clip2Q9Z0H8 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Clip2Q9Z0H8 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Clip2Q9Z0H8 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Clip2Q9Z0H8 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms