Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU28

Pfdn5, Prefoldin subunit 5, mousemouse

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Length 154 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn5Q9WU28 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfdn5Q9WU28 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Nos1-206ENSMUST00000142742 10123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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