Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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