Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZR9

Col4a4, Collagen alpha-4(IV) chain, mousemouse

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Length 1,682 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a4Q9QZR9 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Col4a4Q9QZR9 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Col4a4Q9QZR9 Gng12-205ENSMUST00000114226 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Col4a4Q9QZR9 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Col4a4Q9QZR9 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Col4a4Q9QZR9 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Col4a4Q9QZR9 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Col4a4Q9QZR9 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Col4a4Q9QZR9 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Col4a4Q9QZR9 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Col4a4Q9QZR9 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Col4a4Q9QZR9 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Col4a4Q9QZR9 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Col4a4Q9QZR9 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Col4a4Q9QZR9 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Col4a4Q9QZR9 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Col4a4Q9QZR9 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
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