Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gpc1Q9QZF2 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gpc1Q9QZF2 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gpc1Q9QZF2 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gpc1Q9QZF2 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gpc1Q9QZF2 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gpc1Q9QZF2 AC153962.3-202ENSMUST00000217778 1412 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gpc1Q9QZF2 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gpc1Q9QZF2 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gpc1Q9QZF2 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gpc1Q9QZF2 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gpc1Q9QZF2 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gpc1Q9QZF2 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gpc1Q9QZF2 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gpc1Q9QZF2 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gpc1Q9QZF2 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gpc1Q9QZF2 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gpc1Q9QZF2 Cd3e-201ENSMUST00000102832 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gpc1Q9QZF2 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gpc1Q9QZF2 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gpc1Q9QZF2 Gm24541-201ENSMUST00000103871 96 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gpc1Q9QZF2 2300003K06Rik-201ENSMUST00000105054 1265 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gpc1Q9QZF2 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gpc1Q9QZF2 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gpc1Q9QZF2 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gpc1Q9QZF2 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gpc1Q9QZF2 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gpc1Q9QZF2 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gpc1Q9QZF2 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gpc1Q9QZF2 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gpc1Q9QZF2 Gm25025-201ENSMUST00000175018 111 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gpc1Q9QZF2 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gpc1Q9QZF2 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gpc1Q9QZF2 4833421G17Rik-201ENSMUST00000191704 844 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gpc1Q9QZF2 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gpc1Q9QZF2 Gm36966-201ENSMUST00000192217 413 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gpc1Q9QZF2 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gpc1Q9QZF2 Gm45151-201ENSMUST00000205445 712 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gpc1Q9QZF2 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gpc1Q9QZF2 AC153932.1-201ENSMUST00000218558 787 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gpc1Q9QZF2 AC153522.1-201ENSMUST00000220047 1090 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gpc1Q9QZF2 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gpc1Q9QZF2 AC118006.2-201ENSMUST00000224167 962 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gpc1Q9QZF2 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gpc1Q9QZF2 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gpc1Q9QZF2 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gpc1Q9QZF2 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gpc1Q9QZF2 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gpc1Q9QZF2 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gpc1Q9QZF2 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gpc1Q9QZF2 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gpc1Q9QZF2 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gpc1Q9QZF2 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gpc1Q9QZF2 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gpc1Q9QZF2 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gpc1Q9QZF2 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gpc1Q9QZF2 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gpc1Q9QZF2 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gpc1Q9QZF2 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gpc1Q9QZF2 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gpc1Q9QZF2 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gpc1Q9QZF2 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gpc1Q9QZF2 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gpc1Q9QZF2 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gpc1Q9QZF2 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gpc1Q9QZF2 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gpc1Q9QZF2 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gpc1Q9QZF2 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gpc1Q9QZF2 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gpc1Q9QZF2 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gpc1Q9QZF2 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gpc1Q9QZF2 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gpc1Q9QZF2 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gpc1Q9QZF2 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gpc1Q9QZF2 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gpc1Q9QZF2 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gpc1Q9QZF2 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gpc1Q9QZF2 Gm13313-201ENSMUST00000118938 1084 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gpc1Q9QZF2 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gpc1Q9QZF2 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gpc1Q9QZF2 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gpc1Q9QZF2 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gpc1Q9QZF2 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gpc1Q9QZF2 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gpc1Q9QZF2 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gpc1Q9QZF2 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gpc1Q9QZF2 Olfr886-ps1-201ENSMUST00000212395 708 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gpc1Q9QZF2 Gm19990-201ENSMUST00000219468 1224 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gpc1Q9QZF2 CT572999.1-201ENSMUST00000220315 1260 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gpc1Q9QZF2 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gpc1Q9QZF2 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gpc1Q9QZF2 Acbd7-202ENSMUST00000228935 534 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gpc1Q9QZF2 9230110F15Rik-201ENSMUST00000054175 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gpc1Q9QZF2 Manf-201ENSMUST00000069036 960 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gpc1Q9QZF2 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gpc1Q9QZF2 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gpc1Q9QZF2 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gpc1Q9QZF2 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gpc1Q9QZF2 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gpc1Q9QZF2 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms