Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

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Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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