Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms