Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
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