Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Sfmbt1Q9JMD1 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
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Sfmbt1Q9JMD1 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Sfmbt1Q9JMD1 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Sfmbt1Q9JMD1 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Sfmbt1Q9JMD1 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Sfmbt1Q9JMD1 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Sfmbt1Q9JMD1 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Sfmbt1Q9JMD1 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Sfmbt1Q9JMD1 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Sfmbt1Q9JMD1 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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