Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Tgm1Q9JLF6 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Tgm1Q9JLF6 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
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Tgm1Q9JLF6 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tgm1Q9JLF6 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Tgm1Q9JLF6 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
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Tgm1Q9JLF6 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
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Tgm1Q9JLF6 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tgm1Q9JLF6 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
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Tgm1Q9JLF6 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tgm1Q9JLF6 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
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Tgm1Q9JLF6 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
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Tgm1Q9JLF6 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
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Tgm1Q9JLF6 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
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Tgm1Q9JLF6 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tgm1Q9JLF6 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
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Tgm1Q9JLF6 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tgm1Q9JLF6 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tgm1Q9JLF6 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tgm1Q9JLF6 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
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Tgm1Q9JLF6 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
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Tgm1Q9JLF6 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
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Tgm1Q9JLF6 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
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Tgm1Q9JLF6 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tgm1Q9JLF6 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tgm1Q9JLF6 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tgm1Q9JLF6 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tgm1Q9JLF6 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tgm1Q9JLF6 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tgm1Q9JLF6 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
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Tgm1Q9JLF6 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tgm1Q9JLF6 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tgm1Q9JLF6 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tgm1Q9JLF6 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tgm1Q9JLF6 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tgm1Q9JLF6 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tgm1Q9JLF6 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tgm1Q9JLF6 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tgm1Q9JLF6 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tgm1Q9JLF6 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tgm1Q9JLF6 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Tgm1Q9JLF6 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tgm1Q9JLF6 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tgm1Q9JLF6 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tgm1Q9JLF6 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tgm1Q9JLF6 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
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