Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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