Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms