Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Mrpl39Q9JKF7 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Mrpl39Q9JKF7 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Mrpl39Q9JKF7 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Mrpl39Q9JKF7 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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