Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Xab2Q9DCD2 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Xab2Q9DCD2 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Xab2Q9DCD2 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Xab2Q9DCD2 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Xab2Q9DCD2 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Xab2Q9DCD2 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Xab2Q9DCD2 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Xab2Q9DCD2 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Xab2Q9DCD2 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Xab2Q9DCD2 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Xab2Q9DCD2 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Xab2Q9DCD2 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Xab2Q9DCD2 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Xab2Q9DCD2 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Xab2Q9DCD2 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Xab2Q9DCD2 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Xab2Q9DCD2 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Xab2Q9DCD2 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Xab2Q9DCD2 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Xab2Q9DCD2 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Xab2Q9DCD2 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Xab2Q9DCD2 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Xab2Q9DCD2 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Xab2Q9DCD2 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Xab2Q9DCD2 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Xab2Q9DCD2 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Xab2Q9DCD2 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Xab2Q9DCD2 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Xab2Q9DCD2 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Xab2Q9DCD2 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Xab2Q9DCD2 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Xab2Q9DCD2 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Xab2Q9DCD2 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Xab2Q9DCD2 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Xab2Q9DCD2 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Xab2Q9DCD2 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Xab2Q9DCD2 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Xab2Q9DCD2 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Xab2Q9DCD2 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Xab2Q9DCD2 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Xab2Q9DCD2 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Xab2Q9DCD2 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Xab2Q9DCD2 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Xab2Q9DCD2 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Xab2Q9DCD2 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Xab2Q9DCD2 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Xab2Q9DCD2 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Xab2Q9DCD2 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Xab2Q9DCD2 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Xab2Q9DCD2 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Xab2Q9DCD2 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Xab2Q9DCD2 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Xab2Q9DCD2 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Xab2Q9DCD2 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Xab2Q9DCD2 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Xab2Q9DCD2 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Xab2Q9DCD2 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Xab2Q9DCD2 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Xab2Q9DCD2 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Xab2Q9DCD2 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Xab2Q9DCD2 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Xab2Q9DCD2 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Xab2Q9DCD2 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Xab2Q9DCD2 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Xab2Q9DCD2 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Xab2Q9DCD2 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Xab2Q9DCD2 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Xab2Q9DCD2 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Xab2Q9DCD2 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Xab2Q9DCD2 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Xab2Q9DCD2 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Xab2Q9DCD2 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Xab2Q9DCD2 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Xab2Q9DCD2 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Xab2Q9DCD2 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Xab2Q9DCD2 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Xab2Q9DCD2 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Xab2Q9DCD2 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Xab2Q9DCD2 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Xab2Q9DCD2 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Xab2Q9DCD2 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Xab2Q9DCD2 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Xab2Q9DCD2 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Xab2Q9DCD2 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Xab2Q9DCD2 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Xab2Q9DCD2 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Xab2Q9DCD2 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Xab2Q9DCD2 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Xab2Q9DCD2 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Xab2Q9DCD2 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Xab2Q9DCD2 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Xab2Q9DCD2 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Xab2Q9DCD2 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Xab2Q9DCD2 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Xab2Q9DCD2 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Xab2Q9DCD2 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Xab2Q9DCD2 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Xab2Q9DCD2 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Xab2Q9DCD2 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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