Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Rnf6Q9DBU5 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf6Q9DBU5 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf6Q9DBU5 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf6Q9DBU5 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf6Q9DBU5 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf6Q9DBU5 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf6Q9DBU5 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf6Q9DBU5 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf6Q9DBU5 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf6Q9DBU5 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf6Q9DBU5 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf6Q9DBU5 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf6Q9DBU5 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf6Q9DBU5 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf6Q9DBU5 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf6Q9DBU5 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf6Q9DBU5 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf6Q9DBU5 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf6Q9DBU5 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf6Q9DBU5 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf6Q9DBU5 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf6Q9DBU5 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf6Q9DBU5 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf6Q9DBU5 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf6Q9DBU5 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf6Q9DBU5 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms