Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 AC099612.1-201ENSMUST00000226318 1636 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Impdh2-ps-201ENSMUST00000120826 1545 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Gm10307-201ENSMUST00000189839 1337 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Cav2-203ENSMUST00000115462 694 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Gm11350-201ENSMUST00000121436 870 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Mettl4-ps1-201ENSMUST00000127676 1272 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 A130030D18Rik-201ENSMUST00000128608 654 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Gm13261-201ENSMUST00000137351 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Gm25557-201ENSMUST00000158084 315 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Vmn1r-ps85-201ENSMUST00000173029 890 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 1700108F19Rik-201ENSMUST00000185213 621 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Gm44282-201ENSMUST00000203199 190 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Gm44988-201ENSMUST00000203835 1161 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 AC159819.1-201ENSMUST00000213911 328 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Nsa2-203ENSMUST00000225410 974 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Olfr792-201ENSMUST00000076575 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Gm22864-201ENSMUST00000083950 130 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Zfp973-201ENSMUST00000108985 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Olfr1372-ps1-201ENSMUST00000121007 934 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Gm14435-202ENSMUST00000127687 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 1700071G01Rik-201ENSMUST00000146728 367 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Vmn1r-ps46-201ENSMUST00000173862 949 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 BE692007-201ENSMUST00000186054 954 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Clec2j-202ENSMUST00000203658 606 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Gm45509-201ENSMUST00000209624 1229 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Gm9472-201ENSMUST00000221625 526 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 AC154759.1-201ENSMUST00000224137 1159 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 AC126275.1-201ENSMUST00000224881 446 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Cwc15-201ENSMUST00000004200 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms