Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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Med27Q9DB40 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Med27Q9DB40 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
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Med27Q9DB40 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
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Med27Q9DB40 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Med27Q9DB40 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Med27Q9DB40 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Med27Q9DB40 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Med27Q9DB40 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Med27Q9DB40 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Med27Q9DB40 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Med27Q9DB40 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Med27Q9DB40 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Med27Q9DB40 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Med27Q9DB40 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Med27Q9DB40 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Med27Q9DB40 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Med27Q9DB40 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Med27Q9DB40 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Med27Q9DB40 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Med27Q9DB40 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Med27Q9DB40 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Med27Q9DB40 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Med27Q9DB40 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Med27Q9DB40 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Med27Q9DB40 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Med27Q9DB40 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Med27Q9DB40 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Med27Q9DB40 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
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