Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB10

Smdt1, Essential MCU regulator, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smdt1Q9DB10 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smdt1Q9DB10 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smdt1Q9DB10 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smdt1Q9DB10 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smdt1Q9DB10 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smdt1Q9DB10 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smdt1Q9DB10 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smdt1Q9DB10 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smdt1Q9DB10 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smdt1Q9DB10 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smdt1Q9DB10 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smdt1Q9DB10 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smdt1Q9DB10 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smdt1Q9DB10 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smdt1Q9DB10 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Smdt1Q9DB10 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Smdt1Q9DB10 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Smdt1Q9DB10 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smdt1Q9DB10 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smdt1Q9DB10 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smdt1Q9DB10 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smdt1Q9DB10 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smdt1Q9DB10 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smdt1Q9DB10 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smdt1Q9DB10 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smdt1Q9DB10 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smdt1Q9DB10 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smdt1Q9DB10 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smdt1Q9DB10 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smdt1Q9DB10 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smdt1Q9DB10 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Smdt1Q9DB10 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smdt1Q9DB10 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smdt1Q9DB10 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smdt1Q9DB10 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smdt1Q9DB10 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smdt1Q9DB10 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smdt1Q9DB10 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smdt1Q9DB10 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smdt1Q9DB10 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smdt1Q9DB10 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smdt1Q9DB10 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smdt1Q9DB10 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smdt1Q9DB10 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smdt1Q9DB10 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smdt1Q9DB10 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smdt1Q9DB10 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smdt1Q9DB10 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smdt1Q9DB10 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smdt1Q9DB10 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smdt1Q9DB10 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smdt1Q9DB10 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smdt1Q9DB10 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smdt1Q9DB10 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smdt1Q9DB10 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smdt1Q9DB10 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smdt1Q9DB10 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smdt1Q9DB10 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smdt1Q9DB10 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smdt1Q9DB10 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smdt1Q9DB10 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smdt1Q9DB10 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smdt1Q9DB10 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smdt1Q9DB10 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smdt1Q9DB10 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smdt1Q9DB10 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Smdt1Q9DB10 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smdt1Q9DB10 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smdt1Q9DB10 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smdt1Q9DB10 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smdt1Q9DB10 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smdt1Q9DB10 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smdt1Q9DB10 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smdt1Q9DB10 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Smdt1Q9DB10 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smdt1Q9DB10 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smdt1Q9DB10 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smdt1Q9DB10 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smdt1Q9DB10 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smdt1Q9DB10 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Smdt1Q9DB10 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Smdt1Q9DB10 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smdt1Q9DB10 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smdt1Q9DB10 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smdt1Q9DB10 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smdt1Q9DB10 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smdt1Q9DB10 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smdt1Q9DB10 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smdt1Q9DB10 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smdt1Q9DB10 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smdt1Q9DB10 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Smdt1Q9DB10 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smdt1Q9DB10 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smdt1Q9DB10 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smdt1Q9DB10 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smdt1Q9DB10 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smdt1Q9DB10 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smdt1Q9DB10 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smdt1Q9DB10 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smdt1Q9DB10 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms