Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Usp12Q9D9M2 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
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Usp12Q9D9M2 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
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Usp12Q9D9M2 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Usp12Q9D9M2 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Usp12Q9D9M2 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Usp12Q9D9M2 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Usp12Q9D9M2 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Usp12Q9D9M2 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Usp12Q9D9M2 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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