Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9D5

Tmco5a, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco5aQ9D9D5 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Tmco5aQ9D9D5 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Tmco5aQ9D9D5 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Tmco5aQ9D9D5 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Tmco5aQ9D9D5 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Tmco5aQ9D9D5 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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