Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P4

Mrpl17, 39S ribosomal protein L17, mitochondrial, mousemouse

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Length 176 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl17Q9D8P4 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl17Q9D8P4 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl17Q9D8P4 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl17Q9D8P4 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl17Q9D8P4 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl17Q9D8P4 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl17Q9D8P4 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Mrpl17Q9D8P4 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl17Q9D8P4 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl17Q9D8P4 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl17Q9D8P4 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl17Q9D8P4 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl17Q9D8P4 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl17Q9D8P4 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl17Q9D8P4 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl17Q9D8P4 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl17Q9D8P4 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl17Q9D8P4 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl17Q9D8P4 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl17Q9D8P4 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl17Q9D8P4 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl17Q9D8P4 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl17Q9D8P4 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl17Q9D8P4 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl17Q9D8P4 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl17Q9D8P4 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl17Q9D8P4 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl17Q9D8P4 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl17Q9D8P4 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl17Q9D8P4 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl17Q9D8P4 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl17Q9D8P4 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl17Q9D8P4 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl17Q9D8P4 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl17Q9D8P4 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl17Q9D8P4 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl17Q9D8P4 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl17Q9D8P4 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl17Q9D8P4 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl17Q9D8P4 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl17Q9D8P4 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl17Q9D8P4 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Mrpl17Q9D8P4 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl17Q9D8P4 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl17Q9D8P4 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl17Q9D8P4 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl17Q9D8P4 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl17Q9D8P4 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Mrpl17Q9D8P4 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Mrpl17Q9D8P4 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl17Q9D8P4 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Mrpl17Q9D8P4 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Mrpl17Q9D8P4 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl17Q9D8P4 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl17Q9D8P4 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Mrpl17Q9D8P4 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl17Q9D8P4 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl17Q9D8P4 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Mrpl17Q9D8P4 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Mrpl17Q9D8P4 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Mrpl17Q9D8P4 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Mrpl17Q9D8P4 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl17Q9D8P4 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl17Q9D8P4 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl17Q9D8P4 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl17Q9D8P4 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl17Q9D8P4 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl17Q9D8P4 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl17Q9D8P4 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl17Q9D8P4 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl17Q9D8P4 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl17Q9D8P4 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl17Q9D8P4 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl17Q9D8P4 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl17Q9D8P4 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl17Q9D8P4 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl17Q9D8P4 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl17Q9D8P4 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl17Q9D8P4 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl17Q9D8P4 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl17Q9D8P4 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl17Q9D8P4 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl17Q9D8P4 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl17Q9D8P4 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl17Q9D8P4 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl17Q9D8P4 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl17Q9D8P4 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms