Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8K3

Derl3, Derlin-3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl3Q9D8K3 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Derl3Q9D8K3 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Derl3Q9D8K3 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Derl3Q9D8K3 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Derl3Q9D8K3 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Derl3Q9D8K3 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Derl3Q9D8K3 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Derl3Q9D8K3 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Derl3Q9D8K3 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Derl3Q9D8K3 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Derl3Q9D8K3 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Derl3Q9D8K3 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Derl3Q9D8K3 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Derl3Q9D8K3 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Derl3Q9D8K3 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Derl3Q9D8K3 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Derl3Q9D8K3 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Derl3Q9D8K3 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Derl3Q9D8K3 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Derl3Q9D8K3 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Derl3Q9D8K3 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Derl3Q9D8K3 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Derl3Q9D8K3 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Derl3Q9D8K3 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Derl3Q9D8K3 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Derl3Q9D8K3 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Derl3Q9D8K3 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Derl3Q9D8K3 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Derl3Q9D8K3 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Derl3Q9D8K3 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Derl3Q9D8K3 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Derl3Q9D8K3 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Derl3Q9D8K3 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Derl3Q9D8K3 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Derl3Q9D8K3 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Derl3Q9D8K3 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Derl3Q9D8K3 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Derl3Q9D8K3 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Derl3Q9D8K3 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Derl3Q9D8K3 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Derl3Q9D8K3 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Derl3Q9D8K3 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Derl3Q9D8K3 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Derl3Q9D8K3 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Derl3Q9D8K3 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Derl3Q9D8K3 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Derl3Q9D8K3 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Derl3Q9D8K3 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Derl3Q9D8K3 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Derl3Q9D8K3 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Derl3Q9D8K3 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Derl3Q9D8K3 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Derl3Q9D8K3 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Derl3Q9D8K3 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Derl3Q9D8K3 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Derl3Q9D8K3 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Derl3Q9D8K3 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Derl3Q9D8K3 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Derl3Q9D8K3 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Derl3Q9D8K3 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Derl3Q9D8K3 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Derl3Q9D8K3 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Derl3Q9D8K3 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Derl3Q9D8K3 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Derl3Q9D8K3 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Derl3Q9D8K3 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Derl3Q9D8K3 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Derl3Q9D8K3 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Derl3Q9D8K3 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Derl3Q9D8K3 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Derl3Q9D8K3 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Derl3Q9D8K3 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Derl3Q9D8K3 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Derl3Q9D8K3 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Derl3Q9D8K3 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Derl3Q9D8K3 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Derl3Q9D8K3 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Derl3Q9D8K3 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Derl3Q9D8K3 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Derl3Q9D8K3 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Derl3Q9D8K3 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Derl3Q9D8K3 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Derl3Q9D8K3 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Derl3Q9D8K3 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Derl3Q9D8K3 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Derl3Q9D8K3 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Derl3Q9D8K3 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Derl3Q9D8K3 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Derl3Q9D8K3 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Derl3Q9D8K3 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Derl3Q9D8K3 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Derl3Q9D8K3 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Derl3Q9D8K3 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Derl3Q9D8K3 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Derl3Q9D8K3 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Derl3Q9D8K3 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Derl3Q9D8K3 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Derl3Q9D8K3 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Derl3Q9D8K3 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Derl3Q9D8K3 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms