Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chmp4bQ9D8B3 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chmp4bQ9D8B3 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Chmp4bQ9D8B3 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Chmp4bQ9D8B3 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Chmp4bQ9D8B3 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chmp4bQ9D8B3 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chmp4bQ9D8B3 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Chmp4bQ9D8B3 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chmp4bQ9D8B3 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chmp4bQ9D8B3 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chmp4bQ9D8B3 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chmp4bQ9D8B3 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chmp4bQ9D8B3 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chmp4bQ9D8B3 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chmp4bQ9D8B3 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chmp4bQ9D8B3 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chmp4bQ9D8B3 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chmp4bQ9D8B3 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chmp4bQ9D8B3 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chmp4bQ9D8B3 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chmp4bQ9D8B3 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chmp4bQ9D8B3 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chmp4bQ9D8B3 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chmp4bQ9D8B3 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chmp4bQ9D8B3 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chmp4bQ9D8B3 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Chmp4bQ9D8B3 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Chmp4bQ9D8B3 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chmp4bQ9D8B3 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chmp4bQ9D8B3 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chmp4bQ9D8B3 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chmp4bQ9D8B3 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chmp4bQ9D8B3 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chmp4bQ9D8B3 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chmp4bQ9D8B3 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Chmp4bQ9D8B3 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chmp4bQ9D8B3 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chmp4bQ9D8B3 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Chmp4bQ9D8B3 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chmp4bQ9D8B3 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chmp4bQ9D8B3 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chmp4bQ9D8B3 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chmp4bQ9D8B3 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chmp4bQ9D8B3 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chmp4bQ9D8B3 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chmp4bQ9D8B3 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chmp4bQ9D8B3 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chmp4bQ9D8B3 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chmp4bQ9D8B3 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chmp4bQ9D8B3 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chmp4bQ9D8B3 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chmp4bQ9D8B3 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms