Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

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Length 371 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7Q9D541 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc7Q9D541 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc7Q9D541 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc7Q9D541 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc7Q9D541 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc7Q9D541 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc7Q9D541 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc7Q9D541 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Ccdc7Q9D541 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc7Q9D541 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc7Q9D541 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc7Q9D541 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc7Q9D541 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc7Q9D541 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc7Q9D541 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc7Q9D541 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc7Q9D541 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc7Q9D541 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc7Q9D541 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc7Q9D541 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc7Q9D541 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc7Q9D541 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc7Q9D541 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc7Q9D541 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc7Q9D541 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc7Q9D541 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc7Q9D541 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc7Q9D541 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc7Q9D541 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc7Q9D541 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc7Q9D541 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc7Q9D541 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc7Q9D541 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc7Q9D541 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc7Q9D541 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc7Q9D541 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc7Q9D541 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc7Q9D541 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc7Q9D541 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Ccdc7Q9D541 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc7Q9D541 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc7Q9D541 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc7Q9D541 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Ccdc7Q9D541 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc7Q9D541 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc7Q9D541 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Ccdc7Q9D541 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc7Q9D541 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc7Q9D541 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc7Q9D541 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc7Q9D541 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Ccdc7Q9D541 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc7Q9D541 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc7Q9D541 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc7Q9D541 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc7Q9D541 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Ccdc7Q9D541 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Ccdc7Q9D541 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc7Q9D541 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
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Ccdc7Q9D541 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc7Q9D541 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc7Q9D541 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc7Q9D541 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc7Q9D541 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc7Q9D541 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc7Q9D541 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc7Q9D541 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc7Q9D541 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc7Q9D541 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc7Q9D541 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc7Q9D541 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc7Q9D541 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc7Q9D541 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc7Q9D541 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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