Protein–RNA interactions for Protein: Q9D506

Gm3404, Predicted gene 3404, mousemouse

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Length 307 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3404Q9D506 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm3404Q9D506 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm3404Q9D506 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm3404Q9D506 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm3404Q9D506 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm3404Q9D506 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm3404Q9D506 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm3404Q9D506 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm3404Q9D506 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm3404Q9D506 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm3404Q9D506 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm3404Q9D506 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm3404Q9D506 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm3404Q9D506 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm3404Q9D506 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm3404Q9D506 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm3404Q9D506 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm3404Q9D506 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm3404Q9D506 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm3404Q9D506 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm3404Q9D506 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm3404Q9D506 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm3404Q9D506 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm3404Q9D506 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm3404Q9D506 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm3404Q9D506 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm3404Q9D506 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm3404Q9D506 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm3404Q9D506 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm3404Q9D506 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm3404Q9D506 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm3404Q9D506 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm3404Q9D506 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm3404Q9D506 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm3404Q9D506 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm3404Q9D506 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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