Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PrameQ9D4Z5 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PrameQ9D4Z5 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PrameQ9D4Z5 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PrameQ9D4Z5 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PrameQ9D4Z5 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PrameQ9D4Z5 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PrameQ9D4Z5 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
PrameQ9D4Z5 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PrameQ9D4Z5 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PrameQ9D4Z5 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PrameQ9D4Z5 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PrameQ9D4Z5 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PrameQ9D4Z5 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
PrameQ9D4Z5 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PrameQ9D4Z5 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PrameQ9D4Z5 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PrameQ9D4Z5 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
PrameQ9D4Z5 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PrameQ9D4Z5 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PrameQ9D4Z5 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PrameQ9D4Z5 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PrameQ9D4Z5 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
PrameQ9D4Z5 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PrameQ9D4Z5 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PrameQ9D4Z5 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PrameQ9D4Z5 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PrameQ9D4Z5 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
PrameQ9D4Z5 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PrameQ9D4Z5 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PrameQ9D4Z5 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PrameQ9D4Z5 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PrameQ9D4Z5 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PrameQ9D4Z5 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PrameQ9D4Z5 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PrameQ9D4Z5 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PrameQ9D4Z5 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PrameQ9D4Z5 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PrameQ9D4Z5 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PrameQ9D4Z5 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PrameQ9D4Z5 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PrameQ9D4Z5 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PrameQ9D4Z5 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
PrameQ9D4Z5 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PrameQ9D4Z5 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PrameQ9D4Z5 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PrameQ9D4Z5 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PrameQ9D4Z5 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
PrameQ9D4Z5 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PrameQ9D4Z5 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
PrameQ9D4Z5 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PrameQ9D4Z5 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
PrameQ9D4Z5 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PrameQ9D4Z5 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PrameQ9D4Z5 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PrameQ9D4Z5 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
PrameQ9D4Z5 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PrameQ9D4Z5 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PrameQ9D4Z5 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PrameQ9D4Z5 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
PrameQ9D4Z5 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PrameQ9D4Z5 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PrameQ9D4Z5 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PrameQ9D4Z5 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PrameQ9D4Z5 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PrameQ9D4Z5 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PrameQ9D4Z5 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PrameQ9D4Z5 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PrameQ9D4Z5 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PrameQ9D4Z5 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PrameQ9D4Z5 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PrameQ9D4Z5 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
PrameQ9D4Z5 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PrameQ9D4Z5 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PrameQ9D4Z5 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PrameQ9D4Z5 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PrameQ9D4Z5 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
PrameQ9D4Z5 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PrameQ9D4Z5 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PrameQ9D4Z5 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PrameQ9D4Z5 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PrameQ9D4Z5 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PrameQ9D4Z5 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PrameQ9D4Z5 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PrameQ9D4Z5 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PrameQ9D4Z5 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PrameQ9D4Z5 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PrameQ9D4Z5 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PrameQ9D4Z5 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PrameQ9D4Z5 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PrameQ9D4Z5 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PrameQ9D4Z5 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PrameQ9D4Z5 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PrameQ9D4Z5 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PrameQ9D4Z5 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PrameQ9D4Z5 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
PrameQ9D4Z5 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
PrameQ9D4Z5 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
PrameQ9D4Z5 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PrameQ9D4Z5 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms