Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4W2

Uncharacterized protein C11orf65 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D4W2 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q9D4W2 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q9D4W2 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q9D4W2 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q9D4W2 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q9D4W2 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q9D4W2 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q9D4W2 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q9D4W2 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q9D4W2 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms