Protein–RNA interactions for Protein: Q9D384

Snrnp35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp35Q9D384 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snrnp35Q9D384 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snrnp35Q9D384 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Snrnp35Q9D384 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snrnp35Q9D384 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snrnp35Q9D384 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Snrnp35Q9D384 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snrnp35Q9D384 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Snrnp35Q9D384 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snrnp35Q9D384 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Snrnp35Q9D384 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snrnp35Q9D384 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snrnp35Q9D384 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snrnp35Q9D384 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Snrnp35Q9D384 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Snrnp35Q9D384 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snrnp35Q9D384 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snrnp35Q9D384 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snrnp35Q9D384 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snrnp35Q9D384 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snrnp35Q9D384 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snrnp35Q9D384 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snrnp35Q9D384 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snrnp35Q9D384 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snrnp35Q9D384 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snrnp35Q9D384 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snrnp35Q9D384 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snrnp35Q9D384 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snrnp35Q9D384 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snrnp35Q9D384 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snrnp35Q9D384 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snrnp35Q9D384 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snrnp35Q9D384 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snrnp35Q9D384 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snrnp35Q9D384 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snrnp35Q9D384 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snrnp35Q9D384 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snrnp35Q9D384 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Snrnp35Q9D384 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snrnp35Q9D384 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snrnp35Q9D384 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snrnp35Q9D384 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Snrnp35Q9D384 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snrnp35Q9D384 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snrnp35Q9D384 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snrnp35Q9D384 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snrnp35Q9D384 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Snrnp35Q9D384 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snrnp35Q9D384 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snrnp35Q9D384 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snrnp35Q9D384 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snrnp35Q9D384 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snrnp35Q9D384 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snrnp35Q9D384 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snrnp35Q9D384 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Snrnp35Q9D384 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snrnp35Q9D384 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snrnp35Q9D384 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snrnp35Q9D384 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snrnp35Q9D384 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snrnp35Q9D384 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snrnp35Q9D384 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snrnp35Q9D384 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snrnp35Q9D384 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snrnp35Q9D384 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snrnp35Q9D384 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snrnp35Q9D384 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snrnp35Q9D384 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snrnp35Q9D384 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snrnp35Q9D384 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snrnp35Q9D384 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snrnp35Q9D384 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snrnp35Q9D384 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snrnp35Q9D384 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snrnp35Q9D384 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snrnp35Q9D384 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snrnp35Q9D384 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snrnp35Q9D384 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snrnp35Q9D384 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snrnp35Q9D384 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snrnp35Q9D384 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snrnp35Q9D384 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snrnp35Q9D384 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snrnp35Q9D384 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snrnp35Q9D384 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snrnp35Q9D384 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snrnp35Q9D384 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snrnp35Q9D384 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Snrnp35Q9D384 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snrnp35Q9D384 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snrnp35Q9D384 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snrnp35Q9D384 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snrnp35Q9D384 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snrnp35Q9D384 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snrnp35Q9D384 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snrnp35Q9D384 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snrnp35Q9D384 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snrnp35Q9D384 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snrnp35Q9D384 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snrnp35Q9D384 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms