Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt20Q9D312 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt20Q9D312 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt20Q9D312 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt20Q9D312 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt20Q9D312 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt20Q9D312 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt20Q9D312 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt20Q9D312 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt20Q9D312 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt20Q9D312 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt20Q9D312 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt20Q9D312 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt20Q9D312 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt20Q9D312 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt20Q9D312 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt20Q9D312 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt20Q9D312 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt20Q9D312 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt20Q9D312 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt20Q9D312 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt20Q9D312 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt20Q9D312 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt20Q9D312 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt20Q9D312 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt20Q9D312 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt20Q9D312 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt20Q9D312 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt20Q9D312 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt20Q9D312 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt20Q9D312 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt20Q9D312 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt20Q9D312 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt20Q9D312 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt20Q9D312 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt20Q9D312 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt20Q9D312 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt20Q9D312 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Krt20Q9D312 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt20Q9D312 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt20Q9D312 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt20Q9D312 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
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Krt20Q9D312 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt20Q9D312 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt20Q9D312 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt20Q9D312 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt20Q9D312 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt20Q9D312 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt20Q9D312 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt20Q9D312 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt20Q9D312 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt20Q9D312 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt20Q9D312 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Krt20Q9D312 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Krt20Q9D312 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Krt20Q9D312 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Krt20Q9D312 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Krt20Q9D312 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Krt20Q9D312 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Krt20Q9D312 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Krt20Q9D312 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Krt20Q9D312 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Krt20Q9D312 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Krt20Q9D312 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Krt20Q9D312 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Krt20Q9D312 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Krt20Q9D312 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Krt20Q9D312 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Krt20Q9D312 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Krt20Q9D312 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Krt20Q9D312 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Krt20Q9D312 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Krt20Q9D312 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Krt20Q9D312 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Krt20Q9D312 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Krt20Q9D312 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Krt20Q9D312 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Krt20Q9D312 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Krt20Q9D312 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Krt20Q9D312 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Krt20Q9D312 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Krt20Q9D312 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Krt20Q9D312 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Krt20Q9D312 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt20Q9D312 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt20Q9D312 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt20Q9D312 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt20Q9D312 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt20Q9D312 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt20Q9D312 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt20Q9D312 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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