Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q2

Trmt44, Probable tRNA (uracil-O(2)-)-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 713 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt44Q9D2Q2 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trmt44Q9D2Q2 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trmt44Q9D2Q2 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trmt44Q9D2Q2 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Trmt44Q9D2Q2 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Trmt44Q9D2Q2 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trmt44Q9D2Q2 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Trmt44Q9D2Q2 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Trmt44Q9D2Q2 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Trmt44Q9D2Q2 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trmt44Q9D2Q2 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trmt44Q9D2Q2 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trmt44Q9D2Q2 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Trmt44Q9D2Q2 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trmt44Q9D2Q2 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trmt44Q9D2Q2 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trmt44Q9D2Q2 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trmt44Q9D2Q2 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trmt44Q9D2Q2 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trmt44Q9D2Q2 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trmt44Q9D2Q2 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trmt44Q9D2Q2 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trmt44Q9D2Q2 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Trmt44Q9D2Q2 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Trmt44Q9D2Q2 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trmt44Q9D2Q2 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trmt44Q9D2Q2 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Trmt44Q9D2Q2 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trmt44Q9D2Q2 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trmt44Q9D2Q2 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trmt44Q9D2Q2 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trmt44Q9D2Q2 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trmt44Q9D2Q2 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trmt44Q9D2Q2 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trmt44Q9D2Q2 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trmt44Q9D2Q2 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trmt44Q9D2Q2 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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