Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1D1

Tspan11, Tetraspanin-11, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan11Q9D1D1 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tspan11Q9D1D1 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tspan11Q9D1D1 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tspan11Q9D1D1 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tspan11Q9D1D1 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tspan11Q9D1D1 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tspan11Q9D1D1 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tspan11Q9D1D1 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tspan11Q9D1D1 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tspan11Q9D1D1 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tspan11Q9D1D1 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tspan11Q9D1D1 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Tspan11Q9D1D1 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Tspan11Q9D1D1 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.8 ms