Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Mrpl28Q9D1B9 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Mrpl28Q9D1B9 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Mrpl28Q9D1B9 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Mrpl28Q9D1B9 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Mrpl28Q9D1B9 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Mrpl28Q9D1B9 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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